Trilogie annoncée, il se pourrait que le troisième opus de Bioshock se déroule une nouvelle fois dans les méandres de l'infâme Rapture, cité horrifique à nulle autre pareille.

En effet, Jordan Thomas, directeur créatif chez 2K Marin, a déclaré que la ville marine « est si liée à Bioshock qu'elle doit y figurer d'une manière ou d'une autre. C'est l'un des personnages que l'on ne veut pas voir s'en aller. Je pense que Rapture constitue une source d'inspiration fertile pour chaque expansion que souhaiterait l'équipe. Je suis convaincu qu'il y aura de futurs jeux se déroulant à Rapture quelque soit la période et je crois que la franchise Bioshock est assez importante pour pouvoir évoluer. »

Concernant Bioshock 2, Jordan Thomas révèle qu'il y aura des PNJ qui ne sont pas des chrosômes et avec lesquels il sera possible d'interagir : « Avec Bioshock 2, nous faisons le nécessaire pour que le joueur fasse des rencontres fortes et inoubliables avec des personnages qui ne sont pas des chrosômes pour lesquels vous pourrez éprouver une empathie véritable. »